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Software Para El Diseno de Microarreglos Especificos

Name: Software Para El Diseno de Microarreglos Especificos
Brand: Eae Editorial Academia Espanola
SKU: 06944321
Price: 30.39 EUR
Availability: InStock
Author: Adda Jeanette García-Chéquer
ISBN: 9783848458271

Adda Jeanette García-Chéquer

Lingua

Spagnolo

Libro In brossura

Codice Libristo: 06944321

Casa editrice Eae Editorial Academia Espanola, maggio 2012

Se desarrolló el Programa de Selección de Sondas: PSS, un programa capaz de diseńar parcial o totalm... Descrizione completa

Codice Libristo: 06944321

74 b

30.39 €

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Se desarrolló el Programa de Selección de Sondas: PSS, un programa capaz de diseńar parcial o totalmente microarreglos específicos con el fin de identificar organismos que sean muy semejantes entre ellos. Se eligió como modelo biológico el virus de papiloma humano (HPV) dada su implicación en el desarrollo de cáncer y la alta semejanza entre sus diferentes tipos y subtipos. Se seleccionó el lenguaje Perl por su orientación al manejo de datos biológicos y por su gran potencial en minería de datos. La entrada de este programa es una huella genómica. Las que se usan en este trabajo fueron generadas utilizando un simulador de hibridaciones en microarreglos pero cualquier tabla de resultado de microarreglo (in vitro o in silico) puede utilizarse como alimentación. Se utilizaron más de 100 tipos virales de HPV para diseńar y probar el PSS. Utilizando el PSS se seleccionaron las sondas óptimas para un microarreglo específico para HPV. Obtuvimos 200 sondas específicas para los virus de alto riesgo y 139 sondas para los virus de bajo riesgo. También se seleccionaron sondas específicas para algunos tipos virales como HPV16 (30 sondas), HPV18 (40 sondas), HPV31 (35 sondas), HPV35 (36 sondas)